php中推荐用file()配合FILE_IGNORE_NEW_LINES标志逐行读取文件进行比对，避免换行符误判；大文件或需标准diff格式时应调用系统diff命令并做好路径转义与错误处理。
用 file() 读取文件再逐行对比最直接
PHP 没有内置的“逐行 diff”函数，但 file() 能把文件按行读成数组，配合 array_diff() 或手动循环就能实现基础比对。注意它默认保留换行符（"n"），比对前建议用 FILE_IGNORE_NEW_LINES 标志过滤掉，否则相同内容因换行符存在与否导致误判。
常见错误是直接用 file_get_contents() 后 explode("n", ...)，这在 windows 换行（"rn"）或混合换行场景下容易漏行或拆错。而 file() 内部已做跨平台换行处理，更稳妥。
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file('old.txt', FILE_IGNORE_NEW_LINES | FILE_SKIP_EMPTY_LINES)是推荐写法 - 若需保留原始行号映射，别加
FILE_SKIP_EMPTY_LINES，改用array_filter($lines, 'strlen')后再处理 - 两数组长度差异大时，
array_diff()只返回左数组有、右数组无的行，不反映新增行——得双向调用或改用循环索引比对
用 diff 命令调用系统工具更准（linux/macOS）
当需要类 unix 的标准 diff 输出（如 +/- 格式、上下文行），直接调用系统 diff 更可靠，尤其处理大文件或含特殊字符的文本时，PHP 自实现容易出边界问题。
关键点在于路径必须绝对化，且注意 shell 注入风险：不能直接拼接用户输入的文件名。用 escapeshellarg() 包裹路径，再执行：
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exec('diff ' . escapeshellarg($old_path) . ' ' . escapeshellarg($new_path) . ' 2>&1', $output, $return_code);返回码 $return_code 为 0 表示无差异，1 表示有差异，2 表示文件不可读等错误。输出数组 $output 每项是一行 diff 结果，可逐行解析。
- windows 下可用
fc替代，但格式不兼容，需单独适配 -
diff -u加统一格式参数，方便后续解析（如提取变更行号） - 大文件慎用，避免内存溢出；可加
head -n 100截断输出防止阻塞
修改文件前必须先备份，且用原子写入防损坏
比对只是手段，真正要“改文件”时，直接 file_put_contents() 覆盖原文件极危险：写到一半出错（磁盘满、权限变）会导致文件内容截断或乱码。正确做法是写新文件 + 原子重命名。
- 生成临时文件：
$tmp = tempnam(sys_get_temp_dir(), 'patch_'); - 写入新内容后，用
rename($tmp, $target_file)替换——该操作在绝大多数文件系统上是原子的 - 旧文件备份建议用时间戳后缀：
copy($target_file, $target_file . '.' . date('Ymd_His')); - 千万别用
unlink()+fopen(..., 'w')组合，这不是原子操作
逐行替换要考虑正则转义和上下文匹配
如果比对后要“按规则修改某几行”，比如把所有 http:// 换成 https://，别直接用 str_replace() 全局扫——可能误改注释、字符串字面量或 URL 参数里的协议。
更安全的做法是逐行判断 + 条件替换：
$lines = file($file, FILE_IGNORE_NEW_LINES); foreach ($lines as &$line) { if (preg_match('/^s*urls*:s*["']http:/', $line)) { $line = preg_replace('/http:/', 'https:', $line); } }注意 preg_quote() 对动态模式中的特殊字符做转义；若需跨多行逻辑（如块注释内不替换），单行处理就不够了，得切换成流式读取 + 状态机，复杂度明显上升。
真正难的不是比对，而是理解“哪些行该改、哪些不该改”的业务语义。正则写错一丁点，就可能批量污染配置或代码。